Buonasera,
la tua domanda comprende tante risposte diverse. Comincio da quella che, credo, ti causa più preoccupazioni.
La pineale cistica è quasi sempre una malformazione congenita. Non credo ci sia nulla di cui preoccuparsi. Conosco gente di 20 anni che ce l'ha 4 volte più grande.
Riguardo le irregolarità elencate, è normale, visto che è nato così prematuro che vi siano anomalie, ma queste non necessariamente si possono ritenere causa dei sintomi.
Poichè ha un disturbo oppositivo provocatorio, ti potrei dire (con le poche informazioni che ho) che si tratta di un problema educativo.
Probabilmente, lo avete cresciuto secondo modalità che lo hanno viziato (facile immaginare che lo avete sempre considerato a rischio e gli avete fatto passare cose che altrimenti non avreste consentito), non solo voi, ma anche nonni e zii.
Adesso, si può riprendere con un programma serio di insegnamento: doveri (prima) e diritti (poi).
In nessun caso devi considerare i sintomi dovuti alla malformazione.