Salve,
atteso che a quanto scrivi hai fatto tutto ciò che si doveva fare, ritengo che il dolore che riferisci in una fase sub-acuta alle scapole (dove esattamente? in mezzo? su una di esse o su entrambe?) soprattutto al mattino, potrebbe essere riferito ad un'eventuale compressione nervosa o articolare.
Se il dolore persiste, indaga ulteriormente con una second opinion da un ortopedico.
Saluti